索引

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__init__() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) (allfunc.Calculator のメソッド) (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のメソッド) (allfunc.ClusterManager_each_sublattice のメソッド) (allfunc.CorrFunction_each_sublattice のメソッド) (allfunc.CSV_Reader のメソッド) (allfunc.Fixstars_Amplify のメソッド) (allfunc.NewStructures_each_sublattice のメソッド) (allfunc.Prepare_Config のメソッド) (allfunc.ProbeStructure_each_sublattice のメソッド) (allfunc.Slab_Processor のメソッド) (allfunc.SurfaceAtomsManager のメソッド) (dashboard.DashApp のメソッド) (visualize.VisualizationManager のメソッド)

A

add_further_model() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) add_user_structure() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) add_user_structure_origin() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) add_vacuum() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) additional_cf_optimization() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) adjust_concentration_each_layer() (allfunc モジュール) adsorption_Carbon() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

adsorption_CO() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) adsorption_Hydrogen() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) adsorption_moledule() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) adsorption_Oxygen() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) all_cf_names (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のプロパティ) allfunc module Annealing_Machine_Converter (allfunc のクラス)

B

basisindex_by_tag() (allfunc.SurfaceAtomsManager のメソッド) best_bits2model() (allfunc モジュール)

bit2energy() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) build() (allfunc.ClusterManager_each_sublattice のメソッド) bulk2slab() (allfunc モジュール)

C

calculate() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) (allfunc.CSV_Reader のメソッド) calculate_composition() (visualize.VisualizationManager のメソッド) calculate_rdf() (visualize.VisualizationManager のメソッド) Calculator (allfunc のクラス) CESlab_nowarning() (allfunc モジュール) cf_calculator_each_sublattice() (allfunc モジュール) check_max_cluster_size() (allfunc モジュール) check_position_overlap() (allfunc モジュール) check_type() (allfunc モジュール) cluster2index() (allfunc モジュール)

cluster_list_for_template() (allfunc.ClusterManager_each_sublattice のメソッド) cluster_mng (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のプロパティ) ClusterExpansionExcutor (allfunc のクラス) ClusterExpansionSettings_nowarning (allfunc のクラス) ClusterManager_each_sublattice (allfunc のクラス) convert_nanosheet_into_slab() (allfunc モジュール) CorrFunction_each_sublattice (allfunc のクラス) create_cluster_list_and_trans_matrix() (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のメソッド) csv_read() (allfunc.Calculator のメソッド) CSV_Reader (allfunc のクラス) csv_write() (allfunc.Calculator のメソッド) csv_write_formationE() (allfunc.Calculator のメソッド)

D

DashApp (dashboard のクラス) dashboard module

decode_to_universal_style() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) (allfunc.Fixstars_Amplify のメソッド) default_parameters (allfunc.CSV_Reader の属性)

E

ECI_evaluate() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) ECI_evaluate_with_cf_optimization() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド)

encode_to_annealing_machine() (allfunc.Fixstars_Amplify のメソッド) endcode_to_annealing_machine() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド)

F

Fixstars_Amplify (allfunc のクラス)

G

generate_probe_structure() (allfunc.NewStructures_each_sublattice のメソッド) get_available_plots() (visualize.VisualizationManager のメソッド) get_basis_function() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) get_cf_by_names() (allfunc.CorrFunction_each_sublattice のメソッド)

get_composition_candidate() (visualize.VisualizationManager のメソッド) get_ECI() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) get_potential_energy() (allfunc.CSV_Reader のメソッド) get_surfaceatoms() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

I

implemented_properties (allfunc.CSV_Reader の属性)

index_by_basis (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のプロパティ) index_by_basis() (allfunc.SurfaceAtomsManager のメソッド)

L

load() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

M

make_qubit() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) make_QUBO() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) model_addition_random() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) model_expansion() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

module allfunc dashboard visualize

N

NewStructures_each_sublattice (allfunc のクラス)

nolabel (allfunc.CSV_Reader の属性)

O

optimization() (allfunc.Calculator のメソッド)

output_symmetry() (allfunc モジュール)

P

plot_ECIs() (allfunc モジュール) plot_fit() (allfunc モジュール) plot_QUBO() (allfunc モジュール)

Prepare_Config (allfunc のクラス) ProbeStructure_each_sublattice (allfunc のクラス) process_iter() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

R

read() (allfunc.Prepare_Config のメソッド) reload_config() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド)

remove_vacuum() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) run() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) (allfunc.Fixstars_Amplify のメソッド)

S

save() (allfunc.Prepare_Config のメソッド) save4visualize() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) save_cif() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) save_vasp() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) search_surfaceatoms() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) selective_dynamics() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) set_cif_list() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) set_default_penalty() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) set_leyer_number() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) set_model_id() (allfunc.CSV_Reader のメソッド) set_model_type() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

set_vaccum_thickness() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) setting_constraints() (allfunc.Annealing_Machine_Converter のメソッド) (allfunc.Fixstars_Amplify のメソッド) setup_callbacks() (dashboard.DashApp のメソッド) setup_layout() (dashboard.DashApp のメソッド) single_point() (allfunc.Calculator のメソッド) Slab_Processor (allfunc のクラス) sort() (allfunc.Slab_Processor のメソッド) storage_path_initialize() (allfunc モジュール) SurfaceAtomsManager (allfunc のクラス) symmetry_equivalent_arrange() (allfunc モジュール)

T

tag2grouped_basis() (allfunc.ClusterExpansionSettings_nowarning のメソッド)

U

unconverged_calculate() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) undo_z_wrap() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

update_formation_energy() (allfunc.ClusterExpansionExcutor のメソッド) update_radiusdict() (allfunc.Slab_Processor のメソッド)

V

validate_calculatedCF() (allfunc モジュール) view_composition() (visualize.VisualizationManager のメソッド) view_energy() (visualize.VisualizationManager のメソッド) view_model() (visualize.VisualizationManager のメソッド) view_rdf() (visualize.VisualizationManager のメソッド)

view_relativeposition() (visualize.VisualizationManager のメソッド) VisualizationManager (visualize のクラス) visualize module visualize_symmetry_operation() (allfunc モジュール)

W

write() (allfunc.Prepare_Config のメソッド)